康藏研究中心正式成立于1994年，是全國最早成立的本專業研究機構。2001年6月12日，為了加強對四川藏區的研究，根據省委要求，“四川省康藏研究中心”在我院正式成立。四川省康藏研究中心，是貫徹省委關于加強對我省康藏地區發展穩定問題研究精神成立的專業研究機構，同時也是國內第一個以康藏地區（四川藏區）為對象的專門的綜合性學術研究機構。主要從事有關康巴藏區兼涉其它藏區歷史、文化、發展和穩定的理論性、基礎性、前瞻性研究和我省藏區歷史文化旅游資源的發掘、轉化、規劃等應用性研究。中心主要研究方向：一是“四川藏區社會穩定與發展研究”。主要是對康藏地區經濟發展與社會穩定關系、宗教信仰研究和民族團結等進行研究。二是“康藏社會歷史文化研究”。主要是對康藏社會歷史文化、藏區文化資源的發掘和開發利用以及康巴文化研究的學術創新等問題進行研究。

為使研究更切合實際，我院康藏研究特別重視與我省涉藏州縣的合作。2005年，我院甘孜州分院掛牌成立。2008年，康藏研究中心在爐霍縣建立了“四川康藏研究中心爐霍研究基地”。分院的設立及基地的建立，為中心科研人員深入基層調研提供了很好的平臺，不僅有利于提高康藏研究的應用性和針對性，更貼合藏區實際搞研究；同時也可借助基地鍛煉我中心青年科研人員，使他們深入實際，既有理論又有實踐經驗。2010年7月26日，四川省康藏研究中心爐霍研究基地在甘孜州爐霍縣正式揭牌，2015年9月24日，四川省康藏研究中心白玉基地也成立揭牌。

在省委宣傳部的支持下，2008年我院將康藏研究作為我院重點建設學科，實行首席專家負責制，從人力、財力上加大扶持力度，制定了中長期學科建設規劃。2010年12月，我院以康藏研究中心為基礎，整合院內有關所的人才，新建立了民族宗教研究所，進一步加強對四川藏區等地區民族問題的研究。目前，康藏研究中心共有在編人員 9名，其中研究員2名，副研究員1名，助理研究員6名。特約研究員10多名。

中心從成立以來即采取開放式辦中心的路子，集中各方面有關專家組成學術委員會，并聘請一批有較高學術造詣和實踐經驗的專家為研究員和學術顧問。采取以課題為紐帶的研究項目運作方式，以達到優勢互補，共同協作開展研究的目的。在充分發揮自身研究力量的基礎上，組織協同院外有關機構面向實際、面向基層、緊緊圍繞康藏地區的發展、改革、穩定的問題，承擔了中央部委、國家基金和省、州的大量課題。承擔的課題及發表的科研成果，對于民族文化與民族工作如藏區研究、藏族歷史文化的研究起了一定的推動作用，中心科研人員主持編定的相關規劃對推動藏族地區社會經濟發展也產生了積極的影響。同時，通過課題研究，康藏研究中心與院內各所及兄弟科研院校形成了很好的合作關系，成為我省涉藏研究的重要機構。

中心科研人員先后承擔了《中國歷代治藏經驗與教訓》、《21世紀治藏方略研究》、《藏傳佛教僧人學經與學位晉升專題研究》等中央部委委托課題；承擔了《藏區黃金資源開發的歷史地理研究》、《西部大開發中民族關系變化與政治穩定研究》、《近代康藏民族關系史》、《四川藏區藏傳佛教發展史及其區域特征》、《康藏地區大型工程建設與民族文化保護研究》、《藏傳佛教寺院社區參與及社會化管理的實證研究—以四川藏區為例》、《藏傳佛教青年僧人現狀調查研究》、《近代四川藏區民族交流與社會發展研究》等10多項國家社會科學基金課題；先后承擔了《四川藏區史》、《意識形態與藏區長治久安專題研究》、《四川省藏羌彝走廊文化資源及其保護與利用情況調查》、《構建四川藏區主動治理、依法治理的長效機制研究》等省部級重大課題；先后承擔了《甘孜藏族自治州康巴文化旅游發展總體規劃》、《甘孜藏族自治州文化產業發展規劃》、《甘孜藏族自治州生態旅游產業發展規劃》、《“富民安康”戰略研究》、我省藏區10多個縣的“十一五”、“十二五”、“十三五”社會發展規劃等針對我省藏區社會經濟發展需要的橫向課題30多項。其中，《中國歷代治藏經驗與教訓》、《21世紀治藏方略研究》等研究報告受到中央領導和有關部門的高度重視與肯定，被通報表彰。

中心科研人員先后出版了《四川藏學論文集》、《雪域黃金：西藏黃金的歷史與地理》、《四川州縣建制沿革圖說》、《康藏近代重大事件史料選編》（第一編、第二編）、《任乃強藏學文集》（上、中、下三冊）、《尹昌衡西征史料匯編》、《復興康定——康定歷史文化記憶重構》、《康巴歷史與文化》、《四川藏區的建筑文化》等學術著作。并與巴蜀書社合作策劃出版了“康巴文化叢書”4冊，與西藏社會科學院合作編輯出版了“藏事漢文文獻叢書”5冊。

中心與中國藏學中心、川大、民大合作召開了全國性學術會議“任乃強與康藏研究學術研討會”，合作召開了“格薩爾千年紀念學術討論會會”、“康巴名人論壇”、“中國·九龍——藏彝走廊”、“爐霍霍爾歷史文化研討會”、“白玉歷史文化研討會”等學術研討會議。